根据分析，可以看出目前中国地方政府土地出让中主要存在如下问题：

首先，土地出让数目不断攀升，但其中协议出让所占份额依旧较高。这反映了，尽管国家出台若干条例和法规约束地方政府土地出让方式，但地方政府土地出让中仍以协议出让为主。其背后反映了地方政府孜孜以求实行协议出让土地的强大动力。

其次，土地出让用地用途中，协议出让形式中用于制造业用途所占比重最高，而以招标、拍卖、挂牌等竞争性土地出让形式来看，住宅类和商业性用途面积在总出让面积中所占比重最高。这一规律表明不同的出让方式对不同的用地类型具有选择性特征。

第三，土地出让面积和收入总额的地区分布中，东部发达地区不论是土地出让总面积，还是土地出让金总额都位于前列，而西部地区相较而言则位居最后。说明地区差距会影响土地出让总量的区域分布特点。

最后，以土地出让收入占GDP的比重、土地收入占财政收入的比重、土地出让收入占财政支出的比重三个指标衡量各地区土地出让金相对重要性时，发现不同地区分布中并无显著特征。